Afgelopen maandag, 26 oktober 2020, heeft een leerling van het IJburg College medeleerlingen met een mes bedreigd, zo meldt Het Parool vandaag. De bewuste leerling zou opgefokt naar school zijn gekomen, waarna hij in de gymzaal een mes had getrokken en het groepje leerlingen had bedreigd. De jongere is overgedragen aan politie Amsterdam en door de school geschorst.
Het IJburg College wordt al jaren geplaagd door ernstige incidenten. In 2018 is er een nieuwe rector voor de school aangetrokken. Ook is het uiterlijk van de school aangepast.